Böcker av Ralf Bruno Moura Lopes

La propagation de bactéries multirésistantes est un défi qui ne se limite plus aux environnements hospitaliers, mais représente également un problème croissant en matière de sécurité alimentaire et d'intégrité de l'environnement. Cette étude a porté sur des bactéries résistantes à plusieurs antimicrobiens isolées dans des légumes vendus au Brésil et au Portugal. La caractérisation génomique des isolats a été réalisée par séquençage du génome entier et le mode de vie endophytique a été évalué en utilisant le haricot commun (Phaseolus vulgaris) comme modèle pour l'étude. Dans ce travail, nous démontrons que les légumes peuvent représenter une voie possible pour la dissémination de bactéries, y compris des clones internationaux, porteurs de gènes de résistance cliniquement significatifs pour les humains et les animaux, ce qui constitue une menace sérieuse pour la santé publique.

The spread of multidrug-resistant bacteria and their resistance genes is a serious therapeutic challenge in hospitals and also represents a growing problem that has spread to the environment. In this study, a microbiological and molecular investigation was carried out of critical priority bacterial pathogens isolated from rhizospheric soil and agricultural crop plants. The strains detected showed a potential threat of human and animal exposure to critical priority pathogens or their resistance genes, which represents an alarming risk to public health.

La propagation des bactéries multirésistantes et de leurs gènes de résistance constitue un sérieux défi thérapeutique dans les hôpitaux et représente également un problème croissant qui s'est étendu à l'environnement. Dans cette étude, une enquête microbiologique et moléculaire a été menée sur des bactéries pathogènes prioritaires isolées du sol rhizosphérique et de plantes agricoles. Les souches détectées ont révélé une menace potentielle d'exposition humaine et animale aux pathogènes prioritaires ou à leurs gènes de résistance, ce qui représente un risque alarmant pour la santé publique.

The spread of multi-resistant bacteria is a challenge that is no longer restricted to hospital environments, but also represents a growing problem involving food safety and environmental integrity. This study investigated bacteria resistant to multiple antimicrobials isolated from vegetables sold in Brazil and Portugal. The genomic characterization of the isolates was carried out by whole genome sequencing and the endophytic lifestyle was evaluated using the common bean (Phaseolus vulgaris) as a model for the study. In this work, we demonstrate that vegetables may represent a possible route for the dissemination of bacteria, including international clones, carrying clinically significant resistance genes for humans and animals, constituting a serious threat to public health.

La diffusione di batteri multiresistenti è una sfida che non è più limitata agli ambienti ospedalieri, ma rappresenta anche un problema crescente che coinvolge la sicurezza alimentare e l'integrità ambientale. Questo studio ha analizzato i batteri resistenti a più antimicrobici isolati da verdure vendute in Brasile e Portogallo. La caratterizzazione genomica degli isolati è stata effettuata mediante sequenziamento dell'intero genoma e lo stile di vita endofitico è stato valutato utilizzando il fagiolo comune (Phaseolus vulgaris) come modello di studio. In questo lavoro dimostriamo che gli ortaggi possono rappresentare una possibile via di diffusione di batteri, compresi cloni internazionali, portatori di geni di resistenza clinicamente significativi per l'uomo e gli animali, costituendo una seria minaccia per la salute pubblica.

La diffusione di batteri multiresistenti e dei loro geni di resistenza è una seria sfida terapeutica negli ospedali e rappresenta anche un problema crescente che si è diffuso nell'ambiente. In questo studio è stata condotta un'indagine microbiologica e molecolare su patogeni batterici prioritari isolati dal suolo rizosferico e da piante di colture agricole. I ceppi individuati hanno mostrato una potenziale minaccia di esposizione umana e animale ai patogeni critici prioritari o ai loro geni di resistenza, che rappresenta un rischio allarmante per la salute pubblica.

Die Ausbreitung multiresistenter Bakterien und ihrer Resistenzgene ist eine ernste therapeutische Herausforderung in Krankenhäusern und stellt auch ein wachsendes Problem dar, das sich auf die Umwelt ausgebreitet hat. In dieser Studie wurde eine mikrobiologische und molekulare Untersuchung kritischer vorrangiger bakterieller Krankheitserreger durchgeführt, die aus rhizosphärischen Böden und landwirtschaftlichen Nutzpflanzen isoliert wurden. Die entdeckten Stämme zeigten eine potenzielle Gefahr der Exposition von Mensch und Tier gegenüber kritischen prioritären Krankheitserregern oder deren Resistenzgenen, was ein alarmierendes Risiko für die öffentliche Gesundheit darstellt.

Die Ausbreitung multiresistenter Bakterien ist eine Herausforderung, die sich nicht mehr nur auf Krankenhäuser beschränkt, sondern auch ein wachsendes Problem für die Lebensmittelsicherheit und die Umweltintegrität darstellt. In dieser Studie wurden Bakterien untersucht, die gegen mehrere antimikrobielle Mittel resistent sind und aus in Brasilien und Portugal verkauftem Gemüse isoliert wurden. Die genomische Charakterisierung der Isolate erfolgte durch Sequenzierung des gesamten Genoms, und die endophytische Lebensweise wurde anhand der Ackerbohne (Phaseolus vulgaris) als Modell für die Studie bewertet. In dieser Arbeit zeigen wir, dass Gemüse ein möglicher Verbreitungsweg für Bakterien, einschließlich internationaler Klone, sein kann, die klinisch bedeutsame Resistenzgene für Menschen und Tiere tragen und eine ernsthafte Bedrohung für die öffentliche Gesundheit darstellen.

Gramnegative Bakterien sind wichtige Erreger von Krankheiten in landwirtschaftlichen Kulturen. Die Virulenz dieser Phytopathogene wird häufig durch einen von der Populationsdichte abhängigen Kontrollmechanismus der Genexpression, das Quorum Sensing, gesteuert. Ziel der vorliegenden Studie war es daher, das Potenzial endophytischer Aktinobakterien (gram-positiv) zur Hemmung dieses Mechanismus bei gram-negativen Pflanzen zu bewerten. Isolate, die zu den Arten Microbacterium testaceum, Microbacterium phyllosphaerae und Rhodococcus erythropolis gehören, zeigten das größte Potenzial zur Hemmung der Zell-Zell-Kommunikation. Dies ist der erste Bericht über M. phyllosphaerae mit diesem Merkmal. Darüber hinaus wurden die genomischen Profile von M. testaceum, der vorherrschenden Spezies unter den Actinobakterien in dieser Studie, mittels PFGE analysiert und zeigten einen hohen Polymorphismus unter den Isolaten. In dieser Arbeit wurde gezeigt, dass endophytische Aktinobakterien das Quorum Sensing gramnegativer Bakterien hemmen können und daher für die Entwicklung nachhaltiger Strategien zur Bekämpfung von Phytopathogenen nützlich sein können.

Gram-negative bacteria are important etiological agents of diseases in agricultural crops. The regulation of virulence of these phytopathogens is frequently mediated by the population density-dependent control mechanism of gene expression, quorum sensing. Thus, the present study aimed to evaluate the potential of endophytic (gram-positive) actinobacteria to inhibit this mechanism in gram-negatives. Isolates belonging to the species Microbacterium testaceum, Microbacterium phyllosphaerae and Rhodococcus erythropolis showed the greatest potential for inhibiting cell-cell communication. This is the first report of M. phyllosphaerae with this characteristic. In addition, the genomic profiles of M. testaceum, the predominant species among the actinobacteria in this study, were analyzed by PFGE and revealed a high polymorphism among isolates. In this work, it was demonstrated that endophytic actinobacteria can inhibit the quorum sensing of gram-negatives and therefore be useful for the development of sustainable strategies for the control of phytopathogens.

Gramotricatel'nye bakterii qwlqütsq wazhnymi ätiologicheskimi agentami zabolewanij sel'skohozqjstwennyh kul'tur. Regulqciq wirulentnosti ätih fitopatogenow chasto oposredowana zawisqschim ot plotnosti populqcii mehanizmom kontrolq äxpressii genow - kworum sensingom. Takim obrazom, cel'ü nastoqschego issledowaniq bylo ocenit' potencial ändofitnyh aktinobakterij (grampolozhitel'nyh) dlq ingibirowaniq ätogo mehanizma u gramotricatel'nyh kul'tur. Izolqty, prinadlezhaschie k widam Microbacterium testaceum, Microbacterium phyllosphaerae i Rhodococcus erythropolis, pokazali naibol'shij potencial dlq ingibirowaniq swqzi mezhdu kletkami. Jeto perwoe soobschenie o M. phyllosphaerae s takoj harakteristikoj. Bolee togo, genomnye profili M. testaceum, preobladaüschego wida sredi aktinobakterij w dannom issledowanii, byli proanalizirowany metodom PFGE i wyqwili wysokij polimorfizm sredi izolqtow. V dannoj rabote bylo prodemonstrirowano, chto ändofitnye aktinobakterii mogut podawlqt' kworum sensing gramotricatel'nyh bakterij i, sledowatel'no, byt' poleznymi dlq razrabotki ustojchiwyh strategij bor'by s fitopatogenami.

I batteri Gram-negativi sono importanti agenti eziologici di malattie nelle colture agricole. La regolazione della virulenza di questi fitopatogeni è spesso mediata dal meccanismo di controllo dell'espressione genica dipendente dalla densità della popolazione, il quorum sensing. Pertanto, il presente studio mirava a valutare il potenziale degli attinobatteri endofiti (gram-positivi) nell'inibire questo meccanismo nelle colture gram-negative. Gli isolati appartenenti alle specie Microbacterium testaceum, Microbacterium phyllosphaerae e Rhodococcus erythropolis hanno mostrato il maggior potenziale di inibizione della comunicazione cellula-cellula. Questa è la prima segnalazione di M. phyllosphaerae con questa caratteristica. Inoltre, i profili genomici di M. testaceum, la specie predominante tra gli actinobatteri in questo studio, sono stati analizzati mediante PFGE e hanno rivelato un elevato polimorfismo tra gli isolati. In questo lavoro è stato dimostrato che gli attinobatteri endofiti possono inibire il quorum sensing dei batteri gram-negativi e, quindi, essere utili per lo sviluppo di strategie sostenibili per il controllo dei fitopatogeni.

Le malattie microbiche sono una delle principali cause di riduzione della produttività delle colture agricole, con conseguenti perdite importanti per molti Paesi. Il Bacillus thuringiensis è una specie che si trova naturalmente associata al suolo, agli insetti e alle piante. Sebbene la maggior parte degli studi su questa specie si concentri solo sui suoi effetti diretti contro gli insetti parassiti, dimostriamo che possono esistere diversi altri meccanismi di protezione delle piante, soprattutto contro i microrganismi fitopatogeni. In questo lavoro, il sequenziamento del genoma del B. thuringiensis BAC3151 endofita del fagiolo comune (Phaseolus vulgaris), oltre ad altri genomi della specie pubblicati in precedenza, ci ha dato l'opportunità di eseguire analisi comparative tra diversi ceppi. In sintesi, il libro contribuirà in modo significativo alla ricerca di strategie innovative per effettuare il controllo biologico delle malattie microbiche nelle colture agricole, con l'obiettivo di ridurre i danni causati dai fitopatogeni.

Mikrobnye zabolewaniq qwlqütsq odnoj iz osnownyh prichin snizheniq urozhajnosti sel'skohozqjstwennyh kul'tur, chto priwodit k krupnym ubytkam dlq mnogih stran. Bacillus thuringiensis - äto wid, estestwennym obrazom swqzannyj s pochwoj, nasekomymi i rasteniqmi. Hotq bol'shinstwo issledowanij ätogo wida sosredotocheno tol'ko na ego prqmom dejstwii protiw nasekomyh-wreditelej, my pokazywaem, chto mozhet suschestwowat' neskol'ko drugih mehanizmow zaschity rastenij, osobenno protiw fitopatogennyh mikroorganizmow. V dannoj rabote sekwenirowanie genoma ändofitnogo B. thuringiensis BAC3151 iz fasoli obyknowennoj (Phaseolus wulgaris), w dopolnenie k drugim ranee opublikowannym genomam ätogo wida, dalo nam wozmozhnost' prowesti srawnitel'nyj analiz mezhdu razlichnymi shtammami. V celom, kniga wneset znachitel'nyj wklad w poisk innowacionnyh strategij biologicheskogo kontrolq mikrobnyh zabolewanij sel'skohozqjstwennyh kul'tur, naprawlennyh na snizhenie poter', wyzwannyh fitopatogenami.

Mikrobielle Krankheiten sind eine der Hauptursachen für Produktivitätseinbußen bei landwirtschaftlichen Nutzpflanzen, die in vielen Ländern zu großen Verlusten führen. Bacillus thuringiensis ist eine Art, die von Natur aus mit Böden, Insekten und Pflanzen verbunden ist. Obwohl sich die meisten Studien über diese Spezies nur auf ihre direkte Wirkung gegen Insektenschädlinge konzentrieren, zeigen wir, dass es möglicherweise mehrere andere Mechanismen für den Pflanzenschutz gibt, insbesondere gegen phytopathogene Mikroorganismen. Die Sequenzierung des Genoms von B. thuringiensis BAC3151, einem Endophyt der Ackerbohne (Phaseolus vulgaris), zusätzlich zu anderen bereits veröffentlichten Genomen dieser Art, bot uns die Möglichkeit, vergleichende Analysen zwischen verschiedenen Stämmen durchzuführen. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses Buch einen wichtigen Beitrag zur Suche nach innovativen Strategien für die biologische Bekämpfung von mikrobiellen Krankheiten in landwirtschaftlichen Kulturen leisten wird, um die durch Phytopathogene verursachten Verluste zu verringern.

Les maladies microbiennes sont l'une des principales causes de la baisse de productivité des cultures agricoles, entraînant des pertes importantes pour de nombreux pays. Bacillus thuringiensis est une espèce naturellement associée aux sols, aux insectes et aux plantes. Bien que la plupart des études sur cette espèce se concentrent uniquement sur ses effets directs contre les insectes nuisibles, nous montrons qu'il peut exister plusieurs autres mécanismes de protection des plantes, notamment contre les micro-organismes phytopathogènes. Dans ce travail, le séquençage du génome de B. thuringiensis BAC3151 endophyte du haricot commun (Phaseolus vulgaris), en plus d'autres génomes de l'espèce publiés précédemment, nous a donné l'opportunité de réaliser des analyses comparatives entre différentes souches. En résumé, ce livre contribuera de manière significative à la recherche de stratégies innovantes pour effectuer un contrôle biologique des maladies microbiennes dans les cultures agricoles, visant à réduire les pertes causées par les phytopathogènes.

As doenças microbianas constituem uma das principais causas da redução da produtividade das culturas agrícolas, resultando em grandes prejuízos para muitos países. Bacillus thuringiensis é uma espécie naturalmente encontrada associada a solos, insetos e plantas. Embora a maioria dos estudos sobre essa espécie foque somente nos seus efeitos diretos contra insetos praga, nós mostramos que podem existir vários outros mecanismos para a proteção de plantas, especialmente contra microrganismos fitopatogênicos. Neste trabalho, o sequenciamento do genoma de B. thuringiensis BAC3151 endofítico do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris), em adição a outros genomas da espécie publicados previamente, forneceu a oportunidade para realizarmos análises comparativas entre diferentes linhagens. Em resumo, o livro contribuirá de forma significativa na busca de estratégias inovadoras para realizar o controle biológico de doenças microbianas nas culturas agrícolas, visando a reduzir os prejuízos causados por fitopatógenos.

Bactérias gram-negativas são importantes agentes etiológicos de doenças nas culturas agrícolas. A regulação da virulência desses fitopatógenos é frequentemente mediada pelo mecanismo de controle da expressão gênica dependente da densidade populacional, o quorum sensing. Desta maneira, o presente estudo objetivou avaliar o potencial de actinobactérias (gram-positivos) endofíticas para inibir esse mecanismo em gram-negativos. Isolados pertencentes às espécies Microbacterium testaceum, Microbacterium phyllosphaerae e Rhodococcus erythropolis apresentaram maior potencial para a inibição da comunicação célula-célula. Este é o primeiro relato de M. phyllosphaerae com essa característica. Além disso, os perfis genômicos de M. testaceum, a espécie predominante entre as actinobactérias deste estudo, foram analisados por PFGE e revelaram um alto polimorfismo entre os isolados. Neste trabalho, foi demonstrado que actinobactérias endofíticas podem inibir o quorum sensing de gram-negativos e, portanto, ser úteis para o desenvolvimento de estratégias sustentáveis para o controle de fitopatógenos.

A disseminação de bactérias multirresistentes é um desafio que não está mais restrito aos ambientes hospitalares, representando também um problema crescente que envolve segurança alimentar e integridade ambiental. Neste estudo, foi realizada a investigação de bactérias resistentes a múltiplos antimicrobianos isoladas de hortaliças comercializadas no Brasil e em Portugal. A caracterização genômica dos isolados foi realizada por sequenciamento do genoma completo e o estilo de vida endofítico foi avaliado utilizando o feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris) como modelo para o estudo. Neste trabalho, demonstramos que hortaliças podem representar uma possível rota para a disseminação de bactérias, incluindo clones internacionais, carreadoras de genes de resistência clinicamente significantes para seres humanos e animais, constituindo uma séria ameaça à saúde pública.

A disseminação de bactérias multirresistentes e de seus genes de resistência são um sério desafio terapêutico nos hospitais, representando também um crescente problema que tem se estendido para o meio ambiente. Neste estudo, foi realizada uma investigação microbiológica e molecular de patógenos bacterianos de prioridade crítica isolados de solo rizosférico e de vegetais de culturas agrícolas. As linhagens detectadas evidenciaram um ameaça potencial de exposição humana e animal a patógenos de prioridade crítica ou a seus genes de resistência, o que representa um risco alarmante à saúde pública.